El número CAS del neuropèptid Y (porcí) és 83589-17-7; té la fórmula molecular C190H287N55O57 i un pes molecular d'aproximadament 4253,70. El neuropèptid Y (humà/rata) té el número CAS 90880-35-6, la fórmula molecular C189H285N55O57S i un pes molecular d'aproximadament 4271,68; L'emmagatzematge requereix normalment refrigeració a -20 graus. NPY posseeix una conformació única semblant a una forquilla coneguda com el plec "polipèptid pancreàtic".
El neuropèptid Y està àmpliament distribuït per tot el sistema nerviós central; la seva concentració és més alta a l'hipocamp, seguit de l'escorça cerebral, hipotàlem, tàlem, tronc cerebral i cerebel. El nucli arcuat de l'hipotàlem és un lloc primari de la síntesi de NPY. Les poblacions específiques de neurones que expressen NPY-es troben al nucli del rafe dorsal i al gris periaqueductal ventrolateral del tronc cerebral. Al sistema nerviós perifèric, el NPY es localitza principalment amb la noradrenalina als nervis simpàtics i s'allibera de les terminals nervioses simpàtiques. El sistema cardiovascular conté abundants fibres nervioses NPY, amb NPY àmpliament distribuït al voltant del cor i els vasos sanguinis.
